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领域概述
消化系统从口腔延续到肛门，负责摄入食物、将食物粉碎成为营养素（这一过程称为消化）、吸收营养素进入血液，以及将食物的未消化部分排出体外。消化道包括口腔、咽、食管、胃、小肠、大肠、直肠和肛门，还包括一些位于消化道外的器官：胰腺、肝脏和胆囊。
常见的疾病有：胃肠道炎症、出血、机械性肠梗阻、麻痹性肠梗阻、食管炎、脏器衰竭、酒精肝，脂肪肝等。
常见通路
一般炎症性的肠胃炎主要是由于外界刺激引起的炎症反应，会破坏消化道的内表皮细胞，导致消化道内表皮和内基质损伤。表现出肠胃病，与此同时随着内皮和基质细胞的损伤，细胞基质中的蛋白也会出现粪便或血液中。检测样本中的标志蛋白即可。比如：胃黏膜损伤检测胃蛋白酶PP，胃泌素释放肽前体ProGRP的含量上升。通路研究较多的有：
1，Sphingosine kinase and sphingosine-1-phosphate receptor signaling pathway
2，JAK/STAT2 Signal Pathway
3，Retinoic acid Signal Pathway
4，ERK Signal Pathway
常见基因
（列举此类疾病相关性前50的基因名称)
|
KIT |
TNF |
IL6 |
PDGFRA |
IL10 |
|
TP53 |
NOD2 |
APOE |
IL1B |
CD40LG |
|
VEGFA |
IFNG |
TLR4 |
INS |
TGFB1 |
|
SDHC |
APP |
F2 |
SNCA |
HLA-DRB1 |
|
APC |
SDHB |
AKT1 |
PTEN |
CTLA4 |
|
MTHFR |
CCR6 |
TLR4 |
VWR |
EGFR |
|
RET |
CDKN2A |
KRAS |
SMAD4 |
STAT3 |
|
CRP |
GBA |
TLR2 |
FAS |
HLA-DQB1 |
|
ABCB1 |
PRNP |
CCL2 |
HLA-B |
BRAF |
|
CDH1 |
ERBB2 |
CTNNB1 |
LMNA |
MPO |
疾病动物模型
常见的动物疾病模型见下表：
|
模型名称 |
应用动物 |
建模方法 |
|
肝缺血(HI) |
大鼠、小鼠、豚鼠、兔 |
缺血再灌注肝损伤 |
|
肝纤维化(HF) |
大鼠、小鼠 |
CCL4 致肝纤维化，二甲基亚硝胺诱导 |
|
肝功能衰竭(LF) |
大鼠、小鼠、兔、犬 |
肝切除诱发肝衰竭 |
|
酒精性肝病(AH) |
大鼠、小鼠、兔 |
乙醇灌胃加高脂喂养 |
|
肝硬化(LC) |
大鼠、小鼠、兔、犬 |
四氯化碳诱发肝硬化 |
|
食管炎 |
小鼠 |
酸灌注法、半幽门缝扎加贲门肌切开术 |
|
急性胃溃疡(AGU) |
大鼠、小鼠 |
乙酰水杨酸、水浸拘束、幽门结扎诱发 |
|
结肠炎 |
大鼠、小鼠、兔 |
乙酸诱导、葡聚糖硫酸钠诱导 |
|
克罗恩病(CD) |
大鼠 |
注射三硝基苯磺酸 |
|
胆囊炎 |
大鼠、小鼠、兔 |
总胆管结扎加细菌感染致胆囊炎 |
|
肠易激综合征(IBS) |
大鼠、小鼠 |
束缚应激、冰水刺激 |
|
肝炎 |
大鼠、小鼠、兔 |
刀豆蛋白A（ConA）诱导的肝炎 |
|
肝内胆汁淤积(IC) |
大鼠、小鼠 |
α-萘基异硫氰酸注射、胆管结扎 |
|
胆结石(GS) |
大鼠、小鼠 |
用致石饲料致胆囊胆固醇结石（GCD） |
|
食管狭窄(ES) |
大鼠、小鼠、兔 |
食管狭窄 |
|
食管静脉曲张(EV) |
大鼠、小鼠 |
门静脉结扎手术 |
|
急性胃炎(AG) |
大鼠、小鼠 |
灌胃加药导致急性胃炎 |
|
慢性胃溃疡(CGU) |
小鼠 |
乙酸烧灼法诱发慢性胃溃疡 |
|
十二指肠溃疡(DU) |
大鼠、小鼠 |
乙酸、半胱胺诱发 |
|
肠粘连(IA) |
大鼠、小鼠、兔 |
手术致肠粘连 |
|
腹腔感染(AI) |
大鼠、小鼠 |
盲肠结扎穿孔(CLP)法导致 |
|
坏死性小肠结肠炎(NEC) |
大鼠 |
人工喂养以及缺氧和冷刺激诱导的新生儿坏死性小肠结肠炎 |
|
腹腔间隔室综合征(ACS) |
大鼠 |
琥珀明胶诱导的腹腔间隔室综合征 |
|
肝外胆汁淤滞(EC) |
大鼠、小鼠、兔 |
结扎胆管致肝外胆汁淤滞 |
|
慢性胰腺炎(CP) |
大鼠、小鼠 |
二氯二丁基致慢性胰腺炎 |
|
胰腺微循环障碍(PMF) |
大鼠、小鼠 |
手术方法致胰腺微循环障碍 |
|
功能性消化不良(FD) |
大鼠 |
不规则饮食加稀盐酸喂养 |
|
黄疸 |
小鼠 |
胆总管双重结扎法导致梗阻性黄疸 |
